Čtyři roky genotypizace českého strakatého skotu (V)

Po úvodních částech byla v minulých dvou dílech vyhodnocena přesnost odhadu genomických PH u býků českého strakatého skotu pro znaky masné užitkovosti a exteriérové znaky. Tento díl bude věnován znakům mléčné užitkovosti.

První společný výpočet znaků mléčné užitkovosti se uskutečnil v prosinci 2014, tedy přesně tři roky po zveřejnění prvních genomických PH. Za necelé tři roky, od výpočtu z prosince 2011 do srpna 2014, vykazují hodnoty pro mléčný index (MW) velmi vysokou korelaci. V tomto období mohlo dojít k nárůstu informací jenom od příbuzných těchto genotypizovaných jedinců nebo v případě starých býků, z nichž osm mělo svoje dcery i v jiných zemích, zde mohlo dojít k nárůstu informací z užitkovosti vlastních dcer.

U mladých jedinců je korelace mezi MW za toho období s hodnotou 0,963, při nárůstu průměrné spolehlivosti z 46 % na 50,5 %. Se zohledněním posunu báze byl zjištěn průměrný rozdíl za toto období v MW v průměru o necelý půl bod (-0,46). Minimální a maximální rozdíly však dosahovaly hodnot -7,5 až +9,5. U starých býků byla korelace o něco nižší (0,944) a také spolehlivost byla hodně nízká (40,5 % při prvním výpočtu a 44,4 při druhém výpočtu). Průměrný rozdíl sice nedosahoval čtvrt bodu (-0,25), ale rozpětí rozdílů bylo od -15,5 do +7,5. Největší propad byl zjištěn u býka, jehož spolehlivost za toto období stoupla z 23 % na 39 %, tedy stále jenom s informacemi z genotypizace, s velmi malou spolehlivostí rodokmenových hodnot (spolehlivost 10 %).

Při porovnání prvního výpočtu s výpočtem přesně o tři roky později (prosinec 2011 s prosincem 2014), tedy již v rámci společného výpočtu, je situace naprosto rozdílná. Spolehlivost MW u skupiny mladých býků, kteří již ve výpočtu z prosince 2014 měli výsledky z prověření na dcerách,  stoupla v průměru na 81,65 %, s minimem 41 a maximem 95 %. Korelace tohoto znaku s prvním výpočtem je pak na hodnotě 0,354. V případě starých býků je situace podobná. Průměrná spolehlivost stoupla až na 94,08 % s minimem 88 a maximem 99 %. Korelace s prvním výpočtem u MW je na úrovni 0,333.

Vzhledem k velmi vysoké přesnosti korelace k srpnu 2014, je proto možné se podívat na rozdíl v hodnotách mléčných znaků jen v rámci po sobě jdoucích výpočtů (srpen a prosinec 2014), z nichž u toho druhého došlo k zapojení české populace do společného výpočtu znaků mléčné užitkovosti.

Ing. Marie Ondráková, Ph.D.

Celý článek najdete v Nch 9/2016

 

Napsat komentář

Vaše emailová adresa nebude zveřejněna. Vyžadované informace jsou označeny *