Genomické hodnocení ovcí a koz

Již notnou řádkou let zavedla Českomoravská společnost chovatelů, a. s. do praxe se genomické testování skotu pomocí SNP čipů. V roce 2024 přešla laboratoř iGenetiky na genotypování koz s využitím DNA čipů (microarray), v letošním roce budou touto metodou genotypovány také ovce.

Stanovování několika desítek tisíc SNP na čipech má své nesporné výhody. Jde zejména o možnost automatického vyhledání rodičů z databází, přesnější výsledky kontrol původů, možnost automatizace a větší průchodnost vzorků laboratoří, možnost stanovení SNP pro užitkovost, exteriér a zdraví společně s ověřením rodičovství, tedy i za jednotnou cenu. Po natestování větší populace zvířat mohou výsledky SNP sloužit také pro různé populační studie nebo pro výpočty plemenných hodnot.

Pro práci s daty vyvíjí ČMSCH online aplikaci, která je obdobou aplikace iGenetika pro genotypování skotu.  Aplikace běží na doméně igenetikakoz.cz. Aplikace slouží nejen pro tvorbu objednávek genotypování, ale i pro evidenci výsledků analýz. Veškerá komunikace tak probíhá čitě prostřednictvím webového rozhraní.

Kromě klasického ověření původu lze z čipu pro ovce vyčíst například genotyp odolnosti vůči scrapii a to u ovcí i koz. U ovcí pak např. geny pro produkci, gen Inverdale (FecX), Neuronální ceroidní lipofuscinózy (NCL), geny pro produkci (DGAT1), myostatin, Glykogen-Storage disease, Yellow fat BCO2, Citrulinemii typu 1 (CTLN1). U koz je testováno celkem více než 700 SNP se známým vlivem na užitkovost a exteriér.